В Коране и Сунне содержатся многочисленные указания на необходимость почитания мечетей и соблюдения норм поведения при их посещении. Поддерживать дух единобожия в мечети — одна из основных обязанностей верующего, поскольку в Коране сказано: «Мечети принадлежат Аллаху. Не взывайте же ни к кому наряду с Аллахом» (сура 72 «Джинны», аят 18). Поэтому Пророк Мухаммад, одержав победу над мекканцами и вступив в Заповедную мечеть, в первую очередь разрушил стоявшие вокруг Каабы идолы. С целью защиты единобожия ислам предписывает с особой тщательностью подбирать места для строительства мечетей и запрещает возводить их на могилах, особенно на могилах праведников, чтобы почитание домов Аллаха не приводило к чрезмерному возвеличиванию покойных.

Отправляясь в мечеть, мусульмане обычно надевают лучшую одежду, а мужчины умащаются благовониями. Коран гласит: «Облекайтесь в свои украшения при каждой мечети» (сура 7 «Ограды», аят 31). Считается, что каждый шаг по пути в мечеть смывает один из совершённых ранее грехов и поднимает человека на одну ступень перед Аллахом, и поэтому желательно идти в мечеть пешком, не спеша и поминая Аллаха.

В мечетях не принято занимать место имама без его разрешения. В одном из хадисов говорится: «Пусть никто не руководит намазом в присутствии хозяина владений и не садится на почётное место в его доме без разрешения». Во времена Пророка мужчины и женщины молились вместе: мужчины занимали передние ряды, а женщины — задние. Сегодня во многих мечетях для мужчин и женщин отводятся раздельные помещения.

Согласно Шариату, в мечетях следует избегать любых поступков, которые могут доставить беспокойство окружающим, воздерживаться от бесполезных разговоров и громкого смеха. Пророк Мухаммад велел не приходить на коллективные намазы тем, кто поел лук или чеснок в сыром виде, чтобы неприятный запах изо рта не вызывал отрицательные эмоции у прихожан и не отвлекал их от размышлений и молитв. В одном из хадисов сообщается, что Пророк велел возводить мечети в жилых кварталах, держать их в чистоте и умащать благовониями.

С целью поддержания чистоты при входе в мечеть мусульмане снимают обувь. В мечетях запрещается сорить и плеваться, а убрать даже соринку с пола считается добрым поступком. Согласно мусульманской традиции, в мечети нельзя находиться в состоянии полового осквернения (не искупавшись после супружеского соития или поллюции), а также женщинам во время месячных кровотечений.

В мечетях запрещается торговать и громко объявлять о пропаже, поскольку торговля отвлекает людей от поклонения Аллаху, а объявление о пропаже вселяет в их души сомнение и недоверие к прихожанам. Шариат запрещает присваивать найденные вещи и обязывает того, кто нашёл ценную вещь, искать её хозяина в течение целого года. И только в том случае, если поиски не принесут никакого результата, находку разрешается оставить себе и использовать. Найденные в мечетях вещи принято сдавать смотрителю, а в крупных мечетях существуют специальные комнаты для хранения находок.